A Bécsi egyetem anyakönyvei már 1415-ben említik az első eperjesi diákot. Az iskola középkori magas színvonalát bizonyítja több végzősének tanulmánya a különböző külföldi egyetemeken Bécsben, Krakkóban, vagy olasz városokban is. Az Evangélikus Kollégium építése után és ennek rendszeres tanítás kezdete, a városi iskola 1667-ben megszűnt. 1673-ban a jezsuita gimnázium kapott helyet benne. A 19. század utolsó harmadából átalakult királyi katolikus gimnáziumba. A régi városi iskola épületét régebben különféle célokra használták, ma a P. O. Hviezdoslavai Regionális Könyvtárat szolgálja ki.
